1、如思路或意思表述不充分
長期從事科研與論文寫作的一線醫學工作者的經驗告訴我們，如思路或意思表述的不充分多半就是源自文獻閱讀量不夠。一篇文章存在刊發的可能性不是因為出現了陽性的結果，而是能為其他醫學工作者提供學術指引，能解決別的研究未曾解決的學術問題。從以上方面看來，沒有一定文獻閱讀量就不會了解研究的進展，也不能為本研究提供一個學術定位。SCI期刊審稿人在審稿的過程中並不看論文的結果是陰性還是陽性，最重要是看究竟有無學術意義。
2、語言問題
中文SCI論文作者都會遇到因一些語言問題而拒稿的情況。很多作者求助於翻譯公司，將中文論文翻譯為英文。這是一種合理的途徑，但關鍵在於是如何選擇價位合理、品質保證的醫學翻譯公司。在選擇SCI醫學論文服務機構時，一定要對其實力進行綜合性考察，尤其是公司基本資質與無發表及審稿成功的經驗。資深編緝都瞭解，在進行sci論文翻譯時，不能只注重字面翻譯，而是根據SCI論文寫作的針對性特點對論文進行修改及翻譯。顯然，毫無醫學專業背景或根本就沒有過發表經驗的服務機構，是完全不足以勝任該項工作的。
3、投稿毫無準備
通常在投稿前要準備的材料包括選定目標期刊、修改論文基本格式、撰寫Cover Letter及推薦審稿人等等。這些資訊來源主要依靠登入期刊網站檢視相應欄目獲得。在這之中，很多作者將撰寫CoverLetter僅僅看成是一封簡單的信件，但實際上並非如此。具有豐富發表經驗的作者將Cover Letter視為展現文章研究價值，促進文章審稿(而非直接拒稿)的必備之法。在CoverLetter中用簡短的句子就能全面概括論文的中心思想，加深編輯對文章價值的.理解。
4、不瞭解線上投稿介面
多數網站的投稿介面是一種遞進式的程式介面，任何一步操作有誤或者資訊輸入格式不正確，最終都不能投稿。因此，必需先檢視投稿須知。論文發表過程中常遇到的問題就是選擇審稿人，此問題可根據期刊的相應檔次選擇適當審稿人，查詢推薦審稿人的姓名及Email等等需要的資訊。必需注意，最終還是由sci期刊來決定是否選用作者推薦的審稿人。