1 引言(前言)
是醫學論文開篇的一段短文，主要介紹本文的背景、理論依據、論文的範圍目的與工作的收穫、結果、意義等。可根據論文的需要或長或短。要求言簡意賅，點明主題。如我院內科1992年2月至1995年10月應用鹽酸納絡酮治療鎮靜催眠藥急性中毒48例，與同期未用納絡酮治療的42例對照比較，療效滿意，報告如下。不可言過其實，尤其是諸如國內外罕見，未見報道，無先例，屬最新水平之類，必須有充分證據，否則一般不用。
2 臨床資料(資料與方法)
是論著的主要內容，包括實驗物件、器具、採用什麼方法、多少病例(男多少、女多少)、如何分組、診斷手斷、依據、治療方法(用藥)、療效標準、觀察及隨訪時間等等。應說明資料來源的時限、年齡、性別、職業的可比性。在此需要特別提醒注意的是說明療效或某種方法時需設對照組，條件同等、隨機分組、用藥或檢測採用雙盲法對照。共同的是使讀者具體瞭解該研究的`具體內容，一方面便於理解和評價，另方面便於驗證和仿行。任何科學成果，必須能夠在方法同樣條件下重複出同樣結果，方能得到公認。因此，描述材料和方法以使讀者能進行重複為度，過分簡略固然不行，過分詳盡也無必要。
資料中如數字較多可用統計圖表表示。統計表應有表題和序號(一個表不用序號，列為附表)。統計表應按統計學原則製作，表格兩端開口，不用縱線，只用一條縱線說明主語與謂語，表格左上角不用斜線。表格內避免繁雜，更不能與正文重複。
3 結果
醫學論文的中心部分。即實驗研究、臨床研究、分析觀察、調查的各種資料和資料，進行分析、歸納，經必要的統計學處理後所得的結果。這是決定論著質量是否嚴謹，資料是否準確可靠，要求高度真實和準確，實事求是的撰寫。失敗就是失敗，成功就是成功，不要人為地誇大成功率，且要消滅統計方面的誤差。
4 討論
即將到來的結論或結果，從理論上進一步仔細分析。科學論證和評估，確認結果的可靠性，闡明科學，先進的引數，得到大家的認可。通常討論的問題：本文闡述的原則和機制;材料和方法，描述了特徵的優缺點;本文的結果和優點和缺點與別人的相似性和差異分析;根據分析結果提出了一個新的假說，新的想法;各種不同的學術的角度來比較和評價;提出了探索未來發展方向等。當然，後通常只討論一些方面不可能面面俱到。這是討論的需要緊密聯絡的重要文章的調查結果，顯示了他們的新發現和新認識。一些醫學論文討論部分只是過去的文獻，重複，甚至複製了一些專著和教材內容，失去了意義。深入討論，正確與否，很大程度上取決於有多少控制文獻和分析能力。因此，我們必須瞭解行業的現狀和發展趨勢，比較客觀地得出正確的結論。
5 醫學論文的參考文獻
只限於自己閱讀過並引用的文獻(必須是公開發行的刊物)，按文內引用順序排列寫在文後，文內按1.2.3順序在引用處標出右上角碼，如在右上角標註[1]或[1-3]或[1,4]最好是著重引用近年的(3-5年)期刊文獻。 醫學論文參考文獻的書寫格式多采用溫哥華式。
刊物:作者(兩位作者可一併列上，中間加逗號;三位作者或以上，可只寫第一作者，後加逗號及等)，文題列於作者後(有的刊物略去文題)，然後順序列出刊物名稱、年份、卷(期):起迄頁。
例 楊亞輝.國內外胸心血管外科進展臨床醫學1995;15(6):36楊亞輝，等.國內外胸心血管外科進展臨床醫學1995;15(6):36一38書籍:依次順序為作者，書名，版次，出版地:出版社，年份:起頁～迄頁。
例 張學禮主編，怎樣撰寫醫學論文第一版，北京:中國醫藥科技出版社，1990:82-90外文資料西文只用姓，不用全稱，其它順序同期刊。
參考文獻不宜過多，論著8條、綜述20條以內為宜。引用的文獻必須具有價值，引用的論點必須準確無誤。取其精華，引用部分要恰到好處，寧少勿濫。