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根據系統論的觀點，學校是一個整體系統。它有一個整體目標，即培養社會主義現代化建設所需要的具有一定素質和特長的，各類各層次後備力量和人才。學校也是一個資訊處理系統，學校運作的過程，就是資訊處理的過程。此外，學校工作還是一個控制系統，圍繞著學校的整體目標，它的各部門都在發揮其自身的作用。那麼，在學校管理中我們該如何運用系統論呢？
一、注重協作，發揮學校計劃的整體性效能
工作計劃的整體性，不能僅是學校有個整體計劃，各部門有個部門計劃就行了（這些當然也很重要，它們是系統功能得以發揮的基礎），更重要的是，作為科學的管理系統，學校各部門之間要建立起良好的結構協助關係，使該計劃的整體效能夠充分發揮其整體效能。
學校中的關係很多，有縱向關係，也有橫向關係，其中最主要的有三個方面：一是領導與教職工的關係；二是教育、教學和後勤的關係；三是師生關係。系統論就是把這些關係整合成一個有機的統一體，它們根據總目標再製定各部門、各崗位的具體目標，同時，協調好本部門與他部門的關係，彼此在同一個總目標下，協同運作，共同前進。
譬如，在師生關係上，我們經常強調的“尊師愛生”，這也是從系統論觀點的要求出發的。一堂課要想獲得較為理想的教學效果，教師的教和學生的學都很重要，但更重要的是教師要了解學生、關愛學生，學生也要了解教師、尊重教師，形成良好的師生關係，發揮整體功能的作用。這種整體功能對於提高教學質量的作用，比起教師和學生各自單方面努力相加之和來，要大得多。
因此，作為校長，要把好學校工作計劃整體性這一關，並且做好各部門的協同工作。
二、加強溝通，實現學校管理工作資訊化
學校管理資訊化在學校的教育教學工作中有著特殊的重要意義。學校工作的物件是不斷髮展變化成長的青少年，他們接受教育教學的情況又比較複雜，如果不能及時準確地掌握資訊，那麼管理工作就很難有成效。如何使學校的管理工作做到資訊化呢？
1、擴大來源，講究資訊蒐集。
獲得豐富的資訊資料，這是學校管理科學化的前提。資訊來源可以是直接蒐集的，也可以是間接獲取到的。具體的資訊來源主要有如下幾方面：看書面資料，直接觀察，聽取彙報，召開有關人員座談會，個別訪問，與學生家長交流，等等。特別強調的是領導和教職工、學生家長之間，教師和學生之間的直接交流，這樣獲取的資訊及時，效率高，真實可靠；在獲取資訊的同時，還可以溝通思想感情，使他們對學校工作增強參與意識，對學校，班級產生責任感。
2、消除屏障，暢通訊息渠道。
影響資訊暢通的因素，主觀方面有：態度是否誠懇，待人是否謙虛，辦事是否民主，方法是否恰當，目的是否明確等等，如果其中任何一個因素處理不妥，或多或少會影響到資訊的蒐集。客觀因素有：目的不明確，對方難以配合；具有疑難心理，難以合作；事不關己，無暇顧及；不感興趣，沒有信心等等。客觀因素在獲取資訊的過程中不是主要矛盾。要消除影響資訊暢通的屏障，關鍵需要當校長、當教師的虛心誠懇，平等待人，從實際工作出發，符合大多數人的利益和願望，那麼就會得到，提供高質量的資訊。
3、科學分析，合理處理資訊。
資訊來自基層，比較錯綜複雜，又有較強的時效性，因此需要及時進行分析，篩選，否則，資訊過時了，也就失去了其應有的價值。分析、處理資訊，首先要去粗取精，去偽存真，壓縮資訊的多餘度，透過現象，找到本質；其次要圍繞工作目標分析處理，不僅要看部門的工作目標，更需要從學校的整體目標出發，這樣，對資訊的分析、處理才能有的放矢；第三要注意數量關係，既要看資訊來自哪些方面，哪些人，還要看來自多少人，涉及多少人，離開數量關係來看資訊，就難保其可信度。有些甚至還需要運用數理統計方法，以使資訊的分析處理具有科學性。
三、適時調控，建立學校工作控制反饋系統
教育教學過程是一個十分複雜的過程，制約它的.因素很多。要保證教育目標的實現，必須建立學校工作的控制反饋系統。
要使學校的控制反饋系統真正有效地執行，首先要提高對建立這一系統重要性的認識：沒有控制反饋，就沒有質量，沒有發展。其次對學校各工作部門要有明確的反饋要求，並形成制度，以保證隨時能夠獲取學校管理，教育教學工作的效果資訊。第三，要掌握和分析顯示工作的實際效果和預期目標之間的偏差情況。一種是沒有偏差，實際工作完全沿著目標實現的方向進行；一種是實際工作與既定目標之間產生了偏差傾向，這就需要了解掌握各個部門功能發揮得怎樣，部門之間各步協調得怎樣，是如何互相影響的，隨著時間的推進，互相間的關係有何變化，利弊如何，等等。第四，掌握了實際工作效果與工作目標之間的偏差資訊之後，主要從質量要求上、時間節奏上、空間關係上、工作方法上等做好調節措施，及時校正偏差。否則，任其發展下去，不加以校正，整個反饋控制就會成為毫無意義的活動。
從系統論的觀點來看，學校管理是一個系統，它與外部環境有著物質、能量和資訊的交換。因此，我們不但應重視和考察所有外部環境與學校教育教學管理之間的相互聯絡和相互作用，而且也必須深入到教育教學管理的內部，去研究分析它的各個組成要點，各要素之間的相互聯絡和相互作用，去了解管理的內部機制，並且健全和優化這種教育教學管理機制，有效地提高教育教學質量。