東北師範大學自然博物館暨吉林省自然博物館始建於1987年7月20日，原隸屬於吉林省文化廳，為吉林省唯一省級自然博物館。2001年1月1日，吉林省政府為讓自然博物館獲得更好發展併發揮更大功能，決定將吉林省自然博物館整建制地劃給東北師範大學，並且每年仍由省財政對自然博物館進行全額撥款，而且決定為建設新館投資4000萬元，另由東北師範大學投資5300萬元，總投資達9000多萬元人民幣建設自然博物館新館。新館建設是吉林省“十五”計劃重點專案之一，場館佔地面積4公頃，建築面積14700平方米，展廳面積6000平方米，庫房面積3000平方米。建築工程於2006年9月10日竣工，展覽於2007年5月1日佈置完畢，並隨即向社會開放。
目前展覽共分《林之韻》、《山之魂》、《蝴蝶谷》、《鳥之靈》、《獸之趣》和《化石世界》六個展區進行展示，其中《林之韻》、《山之魂》為主要展區，它突出吉林省地方特色，主要展示吉林省具有代表性的生態景觀——長白山，其他展區配合介紹了與吉林省生態環境有關的地質古生物、動物、植物等相關知識。陳列展覽中還設計了一些有益於中國小生身心健康的專案，如鼓勵增強勇氣的攀巖，克服恐高心理障礙的高架玻璃橋，滿足探祕心理的林中通幽，提高動手能力的標本製作、擴充套件知識面的聯網計算機知識問答等，讓觀眾在參觀中得到身心的快樂，知識的薰陶，審美的情趣。
展覽的開放將豐富人們的精神文化生活，對普及科學知識、提高公民科學文化素養具有積極的促進作用。展覽的目標是達到全國一流展覽的水平，成為全國博物館陳列展覽的精品。其影響力將覆蓋全省.波及全國。
東北師範大學自然博物館作為吉林省唯一一所從事自然科學普及教育工作的省級博物館，擁有一支強大的專門從事自然科學知識的科學研究、科普宣傳、展覽設計、製作、展示的專業隊伍，並配有專業的講解人員和管理人員。而且，自然博物館自1987年建立以來，就在積極發揮著“自然標本收藏、自然科學研究、科學普及教育”三大自然博物館功能，收藏自然展品3萬多號,5萬1千多件，包括動物、植物、古生物化石、人體、礦物、岩石、隕石等，其中東北地區絕滅動物化石標本4000多件，大型珍稀動物標本7000多件;出版科普著作和科普資料30餘部;舉辦的大型科普展覽10餘個,臨時科普展覽幾十個。
鑑於東北師範大學自然博物館在科學普及工作領域做出的巨大貢獻，1999年被中國科學技術協會認定為“全國科普教育基地”;2000年被長春市教育委員會指定為“長春市中國小生科技活動基地”;2007年被吉林省科學技術廳指定為“吉林省科普基地”;2007年被共青團吉林省委、吉林省教育廳、吉林省少先隊工作委員會、吉林省新聞工作者協會、吉林省教育學會、吉林省學生聯合會等共同認定為“吉林省青少年新聞小記者培訓基地”。
今後，東北師範大學暨吉林省自然博物館將以辦成全國一流的博物館為目標，以一流的設施，一流的陳列，一流的服務迎接海內外廣大觀眾。