建築施工專案公司與傳統企業的不同決定了其在綜合管理中有著不同於一般企業的地方。所以，要做好專案公司的綜合管理，就要按照以專案為核心的原則來積極創新管理方法和管理手段，只有這樣，才能真正使專案公司的綜合管理有利於專案的實施。
一、專案公司的概念和職能
專案公司是以某一專案的實施過程為企業存在時間長度的公司，這種企業的存在就是為了專案的建設，一旦專案建成，可投入使用，公司的使命就結束了。所以，專案公司的存在時間一般都很短，有的3年或5年，也有的不足1年或十幾年的，情況不一樣，但都是與專案的建設週期相一致。
一個專案從形成概念、立項申請、進行可行性研究分析、專案評估決策、市場定位、設計、專案前期準備、實施準備，以及機電裝置和主要材料的選型及採購，專案的施工計劃制定和具體組織實施，工期質量和投資的控制，直至最後的竣工驗收、交付使用，這其中的任何一個環節，都直接影響到工程專案的成敗。現代工程專案管理強調，對專案的管理要貫穿由以上所有環節形成的全過程，而不僅僅是施工階段的管理。所以，在這些過程中，如何協調專案各方利益相關者的關係，確保專案的質量、進度、投資三大目標的實現，是擺在專案公司面前的一個非常重要的問題。具體來講，專案公司的作用主要有以下幾點。
(1)計劃職能。工程專案的各項工作都要以計劃為依據，工程專案計劃是工程專案實施的指導性檔案。所以說，計劃是龍頭，計劃即管理。專案公司要籌劃安排工程專案的預期目標，對工程專案的'全過程、全部目標和全部活動統統納入計劃軌道，用一個動態的可分解的計劃系統來協調控制整個專案。
(2)協調職能。專案公司要在專案的不同階段、不同環節，與相關的不同部門進行協調，雖然不同層次都有各自的管理內容和管理辦法，但他們之間的結合部往往是管理最薄弱的地方，需要通過有效溝通和協調，使專案公司在不同階段、不同環節、不同層次之間實現目標一致，達到時間、空間和資源利用之間的高度統一。
(3)組織職能。在明確部門分工、職責、職權的基礎上，專案公司應建立有效的規章制度，使專案的各階段、各環節都有人負責，形成一個高效的組織保證體系。
(4)控制職能。主要體現在目標的提出和檢查、職能的分解，各種規範的貫徹執行及實施中的反饋和改進。
(5)監督職能。專案公司應依據專案的合同、計劃、規章規範等，對專案的進度、質量等進行監督，確保專案的健康執行並達到預期目標。
二、專案公司綜合管理的原則
專案公司在綜合管理中面臨著眾多急需克服的困難，因此在日常的管理中也應跳出一般企業的管理模式，尋找適合於公司自身特徵的管理模式和管理方法。所以，專案公司在綜合管理中應遵循以下幾條原則。
以專案為核心的原則。專案是專案公司存在的基礎，公司的一切活動都是為專案服務的。在綜合管理中，要以有利於專案的進展為首要目標，各部門、層次和責任制度、規章制度的建立都必須服從於專案的目標。
公平原則。專案公司的人員來自不同的職能部門，如何在公平的前提下，對有著不同利益背景的員工進行考核和激勵是十分重要的。專案公司在制定規章制度和員工績效考核中一定要注意確保公平。
統一指揮的原則。公司的組織特徵決定了專案人員在日常的工作中常常會同時受到原職能部門與專案公司的雙頭領導，這就極大地違背了管理學中統一指揮的原則。所以，在專案公司的綜合管理中，與原職能部門的良好的溝通是必不可少的。
責權利相一致的原則。責權利相統一是管理學中的一個重要原則，在專案公司的綜合管理中要做到各個職位的權利和責任相適應，形成崗位負責制。
精幹高效的原則。綜合管理中要注重效率，各部門和崗位的職責應分工明確，同時避免人浮於事或責任相互推委。應堅持對員工進行團隊協作能力的培養，並定期進行績效考核，確保精幹高效。
三、綜合管理的主要方法
專案的實施是一個複雜的過程，從前期的立項、可行性研究直至最後的竣工驗收，其中的每一個過程都需要專案公司運用科學的方法進行管理。所以專案公司對綜合管理方法的運用也是專案運作成功與否的關鍵因素之一。專案公司的綜合管理內容主要包括：企業的計劃與統計、規劃與調查、綜合平衡與協調排程、制度建設規範考核等四個方面的工作。這四個方面的工作相互聯絡，相互制約，構成專案公司綜合管理的整體。上述綜合管理的原則為綜合管理提供了指導，而公司接下來要做的就是在以上原則的指導下選擇合適的管理方法。具體來講，專案公司的綜合管理方法主要有以下幾方面。
(1)資訊管理與人才管理是企業綜合管理的基礎。首先，設定的統計資訊指標及口徑必須符合自身特點，同時還要滿足同業社會和國際介面。其次，建立必要的統計資訊流程與制度，使統計資訊管理具有可執行和可操作性。再次，具備相應的資源配置(人才、技術和裝備)，譬如：資訊管理組織者、資訊管理者和資訊採集執行者的受專業訓練程度、工作經驗及基本素質，必須與自身設計的技術要求和裝備相匹配。
(2)確立與統計資訊體系相適應的計劃指標。計劃目標的指標設定與統計資訊指標口徑一致，內容應包括主要的經濟技術指標，既能反映企業的基本面貌，又有利於操作。
(3)編制綜合網路計劃。綜合管理不同於戰略管理，它既要圍繞過程複雜，涉及因素眾多的專案目標開展工作，又要對年度內的短期目標實行有效控制。因此，編制綜合網路計劃，就是在專案實施的工程流程的引導下，用網路計劃方法建立本企業的綜合網路控制圖，即總網路圖。
(4)在企業計劃實施過程中，應以系統、資訊與控制原理為指導，圍繞企業開發與經營目標，在過程控制中，搞好綜合平衡與協調排程，及時進行有效調整。
(5)用統一規範的制度來考核，將獎罰分明的激勵機制貫穿於整個目標管理的過程中。要加強專案公司的制度建設，完善公司的各項規章制度特別是獎懲制度，從而促使員工的個人行為與專案目標保持高度一致。
(6)機構落實。專案公司綜合管理必須形成系統管理，因此，應設定一個專門的綜合管理部門，它負責蒐集各種關於專案的資訊，並進行及時的傳遞;並協助公司管理者制定各項規章制度，執行制度的實施;同時，它還要進行員工的績效考核並進行激勵。綜合管理部的設定，要以充分發揮上述作用為目標。可以根據專案的特點設定專案管理小組、專案協調員、技術支援小組和考核小組等幾個主要部分，具體設定要因專案的不同而異。