新疆大學資訊科學與工程學院成立於2001年5月，是新疆維吾爾自治區資訊科學領域辦學規模最大、層次最高的人才培養基地，是新疆大學“211工程”六個重點建設單位之一，是新疆唯一擁有資訊類專業博士和碩士點的單位。學院由電子資訊科學系、計算機科學系、資訊保安系、計算中心組成。自“211工程”一期、二期和三期建設以來，在西安交通大學、武漢大學、清華大學和上海交通大學的學科對口支援下，學院已形成了鮮明的辦學特色和科研優勢，在人才培養，科學研究和服務社會方面，為國家和新疆的資訊化建設做出了重要的貢獻。
學院目前擁有計算機應用技術博士學位授權點,電腦科學與技術博士後流動站；通訊與資訊系統、計算機應用技術、計算機軟體與理論和訊號與資訊處理4個碩士學位授權點；計算機技術和電子通訊技術兩個工程碩士授權點；電子資訊科學與技術、電子資訊工程、通訊工程、電腦科學與技術、資訊保安、網路工程和軟體工程6個本科專業。學院目前在讀的博士和碩士研究生共計300餘人，本科學生1400餘人。
學院現有教職員工140人，其中教授11人，副教授32人。教師中享受國務院政府特殊津貼專家2人，自治區優秀專家2人，自治區教學名師2人；博士生導師7人，碩士生導師19人。教師中已具有博士學位的教師15人。
學院擁有一個自治區重點實驗室“新疆多語種資訊科技實驗室”，一個新疆大學重點實驗室“智慧資訊科技處理實驗室”。擁有由自治區人民政府批准建立的的“新疆民文資訊科技研發中心”。
學院擁有一個自治區級的電工電子實驗教學示範中心。擁有專業教學實驗室18個，校外實習基地10個。
2001年至2010年，學院共獲得國家自然科學基金專案20餘項，國家科技部專案9項，省部級專案10餘項。其它各類科研專案40餘項。獲國家科技進步獎二等獎1項，省部級科技進步獎5項，獲授權專利和軟體著作權登記30餘項。
近年來，學院加大同國內知名IT企業在科學研究和人才培養方面的合作，先後成立了科大訊飛-新疆大學語音處理技術聯合實驗室，美國德州儀器-新疆大學聯合實驗室，美國ALTERA公司-新疆大學聯合實驗室，中興通訊-新疆大學聯合實習基地等。
