哈爾濱工程大學是首批入選國家“211工程”建設和設有研究生院的全國重點大學，是我國“三海一核”(船舶工業、海軍裝備、海洋開發、核能應用)領域重要的人才培養和科學研究基地。哈爾濱工程大學具有光榮的歷史傳統，前身是創建於1953年的中國人民解放軍軍事工程學院(“哈軍工”)。1970年，在哈軍工原址，以海軍工程系全建制及其它各系(部)部分幹部教師為基礎，組建哈爾濱船舶工程學院，1994年更名為哈爾濱工程大學。1978年，學校被國務院確定為全國重點大學;1982年成為首批具有博士、碩士學位授予權的單位;1996年進入首批“211工程”建設高校行列;2002年由教育部批准設立研究生院;2007年，由國防科工委、教育部、黑龍江省政府、海軍四方共建。學校現隸屬於工業和資訊化部。
哈爾濱工程大學軟體學院是2008年8月獲得黑龍江省教育廳正式批覆組建，11月正式成立的哈爾濱工程大學的直屬二級學院。2011年學院軟體工程專業獲批國家一級學科博士點和黑龍江省重點專業建設。學院按照省教育廳的要求，為適應國家和黑龍江省發展軟體產業對人才的迫切需求，該院依託本校電腦科學與技術學科及相關專業的綜合辦學優勢，按照“辦學層次化、運作企業化、管理專業化”的辦學模式，產學研緊密結合，學院在夯實學生的基礎的同時，十分重視學生實踐能力的培養。一方面與國內外知名企業開展多種形式的定製培養，建立實習、實訓基地，為學生提供更多的實踐、鍛鍊的機會;另一方面充分藉助與日、韓、歐美的良好合作基礎，堅持開放式辦學，不斷地、全方位地開展國際學術交流與合作，已與國內外多所知名高校和企業開展合作關係。理論與實踐並重，大力提高辦學水平，使哈爾濱工程大學軟體學院成為我省培養計算機軟體領域高層次、複合型人才的重要基地。哈爾濱工程大學軟體緊密跟蹤人才的實際需求，結合產業實踐和國際IT領域前沿動態制定教學大綱和課程體系，實施與市場接軌的教學計劃，強化外語訓練，開設企業文化、溝通技巧、素質修煉等方面的課程，提高學生的管理、溝通和團隊協作的能力;開設前沿技術課程，真正做到與產業實踐結合，與國際發展接軌。培養適合產業發展需求的基礎紮實、素質全面、具有國際視野和創新能力的高素質人才。
哈爾濱工程大學軟體學院擁有一支高學歷、高職稱、教學科研經驗豐富的師資隊伍和現代化的教學裝置。許多骨幹教師曾被派往美國、英國、加拿大、俄羅斯、澳大利亞以及日本等國進修學習，部分教師在國內的學術組織中任職，享有較高的聲譽。學院還聘請外籍教師和國內外具有資深研發經驗的高階研發人員講座、授課，帶領學生共同完成部分專業課和實踐課教學任務。