土木工程學院是由原哈爾濱建築大學的建築工程學院和原哈爾濱工業大學的建築工程與設計學院的建築工程系合併而成，創建於1920年，是國內少數幾所最早培養土木工程學科專門人才的單位之一。學院設有土木工程、理論與應用力學二個本科專業，結構工程、工程力學、防災減災工程與防護工程和固體力學五個碩士點學科，結構工程、工程力學、防災減災工程與防護工程和岩土工程四個博士點學科;土木工程和力學二個一級學科博士後流動站;結構工程學科設有長江學者獎勵計劃特聘教授崗位。學院擁有1個部級重點實驗室，4個部級重點學科，其中土木工程專業於1995年以優異成績首批通過了國家專業認證評估，並於2000 年6月國家專業複評中再次獲得優秀評價，2001年結構工程學科被評為國家重點學科。
學院現有是一支基礎雄厚、搭配合理、學術思想活躍、整體素質高的教師隊伍。其中中國工程院院士3名，博士生導師16人，教授24人，副教授33 人。其中有博士學位的教師30人，擔任全國學會理事及以上職務的有10餘人。參加國家規範編制的有近20人，在國內外學術刊物中擔任編委的有10餘人，目前，本院在校學生共1723人，其中碩士生125人，博士生66人，在站博士後16人。學院為國家培養了一大批優秀的高質量畢業生。
八十年來，土木工程學院在教學、科研、人才培養、學術交流等方面積極進取、不懈努力，取得了突出成績。目前，本院正在承擔並聯合主持國家自然科學基金九?五重大專案一項，國家自然科學基金12項，其它專案34項。在大跨空間結構、高層鋼結構與輕鋼結構、鋼管砼結構、預應力砼結構、配筋砌體結構、地震工程、結構振動控制、工程結構診治技術，地基與基礎工程，岩土工程災害與防治，結構與工程系統優化，結構可靠度分析與設計等方面取得了高水平成果。